Fluoresenssi In Situ -hybridisaatiossa
Fluoresenssi in situ -hybridisaatio (FISH) on yksi useista tekniikoista, joita käytetään etsimään solujen DNA: ta, etsimällä geenien spesifisiä geenejä tai osia.
Useat erilaiset syöpät liittyvät tunnetuille geneettisille poikkeavuuksille. Ja geneettisellä tavalla emme puhu vain perinnöstä. Elämässä solut voivat tehdä virheitä, kun ne jakautuvat ja kasvavat.
Mutaatiot syöpään liittyvässä DNA: ssa voivat kertyä näihin soluihin.
Kuinka kalat toimivat?
FISH on tekniikka, jossa käytetään fluoresoivia koettimia erityisten geenien tai geenien osien (DNA-sekvenssien) havaitsemiseen. Lääkärin keskuksen laboratoriohenkilöstö ja onkologit käyttävät FISH-ohjelmaa auttaa arvioimaan potilaita, joilla on syöpä, ja joskus seurata potilasta, jolla on jo diagnosoitu syöpä ja hoidettu.
FISH voidaan tehdä erilaisten näytteiden avulla sijainnin ja epäiltyjen syöpätyyppien mukaan: Perifeerisestä verestä peräisin olevat tuumorisolut, luuydinbiopsian tai imusolmukepopulaatiosta ja formaliinista kiinteä parafiiniin upotettu kudos (tämä viittaa näyte kudoksesta, joka on käsitelty laboratoriossa ja upotettu johonkin tyyppiseen vahaan, mikä tekee siitä jäykemmäksi, jotta se voidaan viilentää ohuiksi osiksi ja asentaa katseltavaksi mikroskoopilla).
Mitä kirjaimet tarkoittavat?
FISH: n "H" tarkoittaa hybridisaatiota.
Molekyylihybridisaatiossa käytetään leimattua DNA- tai RNA-sekvenssiä koettimena - visualisoida punainen Lego-tiili, jos haluat. Koettimena käytetään vastaavan Lego-tiilen tai DNA-sekvenssin löytämistä biologisessa näytteessä.
DNA näytteessäsi on kuin Lego-tiilien pinoja, ja useimmat tällaisissa paaluissa olevat tiilet eivät vastaa punaista koettimia.
Ja kaikki tiilet ovat siististi järjestettyinä 23 paria tiilipilareita - jokainen kasa on yksi parillisista homologisista kromosomeista, enemmän tai vähemmän. Toisin kuin Lego-tiilet, punainen Lego-koettimemme on kuin vahva magneetti ja löytää sen ottelun ilman sortumista paaluilla.
"F" tarkoittaa fluoresenssia. Punainen koetin saattaa kadota tiilien paikoissa, joten se on merkitty värillisellä fluoresoivalla väriaineella, jotta se hehkuu. Kun se löytää vastaavuutensa 23 pariloitujen paalujen joukosta, loisteputki paljastaa sen sijainnin. Niinpä nyt voit nähdä, miten tutkijat ja kliinikot voivat käyttää FISHia auttamaan tunnistamaan, missä tietyssä geenissä (mikä kasa tai mikä kromosomi) sijaitsee tietyn yksilön kohdalla.
"I" ja "S" ovat paikalla . Tämä viittaa siihen, että punainen Lego-tiili etsii ottelua näytteessäsi .
Mitä erityisistä verisyöreistä?
FISH: ia ja muita in situ -hybridisaatiomenetelmiä käytetään erilaisten kromosomaalisten poikkeavuuksien diagnosointiin - geneettiseen materiaaliin tehdyt muutokset, muutokset kromosomeissa, mukaan lukien seuraavat:
Poistaminen - osa kromosomista on poissa
Translocation - osa kromosomista hajoaa ja tarttuu toiseen kromosomiin
Invertointi - osa kromosomista repeytyy ja palaa takaisin sisään, mutta päinvastaisessa järjestyksessä
Kopiointi - osa kromosomista on läsnä liian monissa kopioissa solussa
Jokaisella syöpätyypillä voi olla oma joukko kromosomaalisia muutoksia ja relevantteja koettimia. FISH ei ainoastaan auttaisi tunnistamaan alkuperäisiä geneettisiä muutoksia taudinprosessissa kuin syöpä, mutta sitä voidaan käyttää myös hoidon ja taudin remission vasteen seurantaan.
FISHin havaitsemat geneettiset muutokset tarjoavat joskus lisätietoa siitä, miten yksilön syöpä todennäköisesti käyttäytyy, mikä perustuu aiemmin havaittuihin ihmisiin, joilla on samanlainen syöpä ja samanlaiset geneettiset muutokset. Joskus diagnoosin tekemisen jälkeen käytetään FISH-menetelmää, joka kerää lisää tietoja, jotka voivat auttaa ennustamaan potilaan tulosta tai parasta hoitoa.
FISH voi tunnistaa kromosomipoikkeavuudet leukemiassa , mukaan lukien krooninen lymfosyyttinen leukemia (CLL). Kroonisen lymfosyyttisen leukemian / pienen lymfosyyttisen lymfooman hoidossa FISH antaa potilaille mahdollisuuden saada selville prognostinen luokka: hyvä, välitön tai huono. Akuuttia lymfoblastista leukemiaa (ALL) leukemisolujen genetiikka voi kertoa syöpäriskien riskitasosta ja auttaa ohjaamaan terapeuttisia päätöksiä.
FISH-paneelit ovat saatavana myös lymfooma, multippeli myelooma, plasman solujen proliferatiiviset häiriöt ja myelodysplastinen oireyhtymä. Esimerkiksi vaipan solulymfoomassa on translocation, jonka FISH voi havaita nimeltä GH / CCND1 t (11; 14), joka liittyy usein tähän lymfoomaan.
Miksi FISH?
FISH: n etuna on se, että sitä ei tarvitse suorittaa soluille, jotka jakavat aktiivisesti. Sytogeneettinen testaus kestää yleensä noin kolme viikkoa, koska syöpäsolujen tulee kasvaa laboratorioastioissa noin 2 viikkoa ennen kuin ne voidaan testata. Sitä vastoin FISH-tulokset ovat yleensä saatavilla laboratorion sisällä muutamassa päivässä.
> Lähteet:
> Syöpätautien testaus CPT-koodit.
> Fluoresenssi In Situ Hybridisaatio (FISH). http://www.genome.gov/10000206#al-2.
> Fluoresenssi In Situ Hybridisaatio (FISH). http://www.nature.com/scitable/topicpage/fluorescence-in-situ-hybridization-fish-327.
> Wolff DJ, Bagg A, Cooley LD, et ai. Ohjeita fluoresenssiin situ hybridisaatiotesteissä hematologisissa häiriöissä. Journal of Molecular Diagnostics: JMD. 2007, 9 (2): 134-143.