Geenitutkimustyökalu auttaa osoittamaan tyypin 2 diabeteksen geenien yhdistelmiä
Geenitutkimuksen ala räjähtää, kun havaitaan ja tutkitaan enemmän geenejä ja geenimuunnelmia. Useilla geeneillä on jo tunnistettu joitain merkittäviä sairauksia ja sairauksia, kuten syöpä, sydänsairaus ja diabetes .
Gene-vaihtelut, jotka ilmaisevat taudin sekvenssejä, ovat tiedemiehille erityisen kiinnostavia. Näitä muunnelmia kutsutaan SNP: eiksi (single nucleotide polymorphisms).
Yli 500 000 geenillä ihmisen genomissa tutkijoille on ollut hidasta, kun he yrittävät rikkaruohoja heitä selvittämään, mitkä SNP: t ovat vastuussa kroonisista sairauksista, jotka vaikuttavat meihin.
Tähän asti geenien ja geeniklustereiden löytämisen prosessi, joka on vastuussa diabeteksesta, on ollut vähän kuin yrittää löytää neuloja heinäsuovasta.
Michiganin teknillisen yliopiston kehittämä uusi ohjelmistotyökalu voi tehdä geenejä ja geeniklustereita, joilla on merkittävä vaikutus monimutkaisiin sairauksiin. Työkalun avulla tiedemiehet ovat tunnistaneet 11 geenimuutokset, tai SNP: t, jotka liittyvät tyypin 2 diabetekseen .
Ohjelmiston avulla tutkijat voivat keskittyä tarkemmin geenien joukkoon. Se pystyy kaventamaan valintaa tuhansien geenien joukosta, jotka muodostavat ihmisen genomin alaspäin hallittavammalle ryhmälle geenejä ja geenimuunnelmia, jotka todennäköisimmin liittyvät tautiin. Testi menee edelleen käyttämällä tilastomenetelmiä havaitsemaan, mitkä muutokset toimivat yksitellen ja mitkä toimivat yhdessä.
Qiuying Sha, Michiganin teknillisen yliopiston matemaattisten tieteiden apulaisprofessori, kertoo, että "Kroonisten, monimutkaisten sairauksien, kuten Parkinsonin, diabeteksen ja ALS: n [Lou Gehrigin taudin], kanssa on useita geenejä.
Työkalut, jotka auttavat helpottamaan geenien vaihteluiden tunnistamista, voivat auttaa tutkijoita löytämään tyypin 2 diabeteksen syy ja viime kädessä paraneminen.
Lähteet:
(2008, 26. maaliskuuta). Ihmisen genomiprojektin taustalla oleva tieto. Haettu 29. maaliskuuta 2008, Human Genome Project Information -sivustolta: http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/project/info.shtml
Goodrich, M. Tutkijat yhdistävät 11 geneettistä variaatiota tyypin 2 diabetekselle. Haettu 29. maaliskuuta 2008, Michigan Tech News / Media -verkkosivustosta: http://www.admin.mtu.edu/urel/news/media_relations/673