Lue lisää Paenibacillus-lajikannasta VT 400
Kesällä 2016, amerikkalaisen mikrobiologian seuran kokouksessa tutkijat kokoontuivat jakamaan ja keskustelemaan bakteerien ja ihmisten terveydentilaan liittyvistä löydöistä.
Löydöistä löytyi ryhmä, joka kertoi koko genomin tai kokonaisten geenien joukosta bakteerille nimeltä Paenibacillus-lajikanta VT 400 (PVT400). Näitä bakteereja oli aiemmin todettu akuutin lymfoblastisen leukemian (ALL) pediatrisen potilaan sylteessä .
Yksityiskohtaiset tiedot tästä ja tulevista tutkimuksista auttavat tutkijoita selvittämään, voivatko nämä bakteerit olla merkityksellisiä ihmisen sairauksissa, erityisesti akuutissa leukemiassa, joka saa keuhkokuumeesta tai verenkierrosta.
Keuhkokuume kansoissa
Keuhkokuume on johtava kuolinsyy syöpäpotilailla, joilla on neutropenia ja erityisesti akuutteja leukemiaa sairastavilla potilailla. Neutropenia on neutrofiilien vähäinen määrä veren neutrofiileissä, jotka ovat valkosoluja, jotka ovat tärkeitä auttamaan kehoa taistelemaan infektioon .
Alemmat hengitystieinfektiot ovat hyvin yleisiä syöpäpotilailla, ja joidenkin raporttien mukaan 13 - 31 prosenttia kemoterapiaa saaneista leukemiapotilaista ja jopa 80 prosenttia hematopoieettisista kantasolusiirtojen vastaanottajista kokevat vähintään yhden keuhkokuumeen.
Neutropeninen keuhkokuume on mahdollisesti hengenvaarallisia infektioita. Tällaisissa skenaarioissa lääkärit alkavat antibiootterapia välittömästi odottamatta laboratoriotuloksia vahvistaakseen ja määrittävät bakteeri-infektion tyypin - koska on tärkeää aloittaa hoito kerralla, vähentää riskiä, että potilas kuolee infektioon.
Itse asiassa ennaltaehkäisevää hoitoa käytetään tietyissä olosuhteissa, jotka esitetään alla.
Viimeaikaiset edistysaskeleet neutropenisen keuhkokuumeen hallinnassa edistävät toivoa parempien tulosten saavuttamiseksi. Useat lääketieteelliset yhdistykset ovat antaneet päivitetyt ohjeet epäillyn neutropenisen keuhkokuumeen antibioottiterapialle.
Ja on mahdollista, että uudet aineet, jotka edistävät kehon vastauksia infektioon, voivat edelleen parantaa antibioottien toimintaa.
Keskittymällä patogeeneihin potilailla, joilla on neutropenia
Suositukset American Society of Clinical Oncology (ASCO) suosittelevat, että lääkärit yrittävät estää infektio avohoidossa, joilla on syvä neutropenia, mutta ei kuumetta. Antibakteerista ja antifungaalista hoitoa suositellaan, jos neutrofiilien odotetaan pysyvän alle 100 / μl yli seitsemän päivän ajan. Suuntaviivoissa todetaan, että antibakteerisen ehkäisevän hoidon edullinen aine on oraalinen fluorokinoloni, kun taas antifungaaliselle hoidolle on oraalinen triatsoli.
Neutropeniaa sairastavat potilaat ovat alttiita paljon laajemmalle taudinaiheuttajalle kuin vastapuolilleen. Lääkärit voivat auttaa lääkäreitä harkitsemaan, mistä bakteerit tulevat ennustamaan, mitkä antibiootit he todennäköisesti ovat vastustuskykyisiä, ja minkä vuoksi strategiat ovat todennäköisimmin tehokkaimpia.
Paenibacillus-lajit
Tätä tarkoitusta varten tiedemiehet ovat tutkineet PVT400-bakteereita, jotka ovat eristetyt leukemiapotilasta, joka on Paenibacillus-suvun jäsen - sauvan muotoisten bakteerilajien perhe. Tämän ryhmän eri lajit on eristetty maaperästä, vedestä, kasveista, maidosta ja muista kohteista.
Paenibacillus-lajien tiedetään kuitenkin aiheuttavan ihmisen sairautta. .. kunnes viimeaikaiset raportit osoittivat, että kolme erilaista Paenibacillus-lajia voitaisiin mahdollisesti osallistua ihmisen sairauksiin.
Kun PVT 400 eristettiin akuutin lymfoblastisen leukemian pikkulasten potilaan sylteestä , varhaiset tutkimukset osoittivat näiden isolaattien samankaltaisuutta amylolyyttisillä lajeilla, jotka löytyvät lentäen toukkien hindgutista; Tähän mennessä on kuitenkin edelleen totta, että P. amylolyticusta ei ole havaittu ihmisillä, ja lisätutkimukset osoittivat eroja syöpäpotilaan ja muun P.-kannan VT 400 -bakteerien välillä.
amylolyticus-kantoja.
Joten, kun tutkijat tutkivat koko VT 400 -genomin, oli useita mielenkiintoisia havaintoja. Siellä oli geenejä, jotka koodaavat resistenttejä mekanismia kemoterapiaa varten , kuten tunikamysiiniä ja bleomysiiniä. He löysivät myös geenejä monilääkeresistenssiin liittyville bakteeripumppuille, samoin kuin antibioottien, mukaan lukien vankomysiini, fosmidomysiini, tetrasykliini sekä penisilliinien kaltaiset lääkkeet tai beta-laktaamit, vastustuskykyä koodaavat geenit.
Tämän genomitutkimuksen laatijat huomasivat, että Paenibacillus sp. kanta VT 400 auttaa määrittämään Paenibacillus-lajien roolin ihmisen sairauksissa ja antaa tietoa tavanomaisten bakteerien koostumuksesta potilailla, joilla on veriryhmä.
Lähteet:
> Evans SE, Ost DE. Keuhkokuume neutropenisen syöpäpotilaan kohdalla. Curr Opin Pulm Med . 2015; 21 (3): 260-271.
Rybakova D, Wetzlinger U, Müller H et ai. Täydellinen genomisekvenssi Paenibacillus polymyxa -kannasta SB3-1, maaperäisestä bakteerista, jolla on antagonistinen vaikutus kasvipatogeeneihin. Genomi Ilmoittaa . 2015, 3 (2): e00052-15.
De Souza R, Sant'Anna FH, Ambrosini A, et ai. Pseudomonas sp. FeS53a, oletettu kasvien kasvua edistävä bakteeri, joka liittyy rautaa rasitettuihin maaperään kasvaneen riisin kanssa. Genomi Ilmoittaa. 2015, (2): e00248-15. 10,1128 / genomeA.00248-15.
Spence R, Demchick P, Hornitzky M, et ai. Uuden-Seelannin apiaryn valvonta Paenibacillus alveille. NZ Entomol . 2013; 36: 82-86.
Kim KK, Lee KC, Yu H. et ai. Paenibacillus sputi sp. nov., eristetty potilaan keuhkosairaudesta. Int J Syst Evol Microbiol . 2010; 60: 2371-2376.
Mulcahy N. Uusi ASCO: n ohje neutropeniaan ja kuumeeseen. Medscape Medical News. 16. tammikuuta 2013. Saatavilla osoitteessa http://www.medscape.com/viewarticle/777736.
Flowers CR, Seidenfeld J, Bow EJ, et ai. Antimikrobinen profylaksia ja avohoidon hallintaa kuumetta ja neutropeniaa aikuisilla, jotka on hoidettu pahanlaatuisuuden varalta: American Society of Clinical Oncology kliinisen käytännön ohje . J Clin Oncol . 2013; 31 (6): 794-810.